El ex general de división fue uno de los mentores del golpe de 1976 y uno de los hombres más poderosos durante el gobierno del dictador Jorge Rafael Videla (1976 – 1981).

Harguindeguy, quien fue beneficiado por indultos, había logrado eludir a la Justicia, pero finalmente fue detenido, acusado por crímenes de lesa humanidad cometidos en Entre Ríos.

También en abril de este año la Justicia Federal de San Martín ordenó allanamientos en su domicilio junto a los de Videla y del ex general Omar Santiago Riveros, jefe de Institutos Militares de Campo de Mayo.